Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2BP0DI82 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2BP0DI82 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms