Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS17P08708 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS17P08708 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS17P08708 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS17P08708 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS17P08708 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS17P08708 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS17P08708 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS17P08708 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS17P08708 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS17P08708 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS17P08708 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS17P08708 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS17P08708 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS17P08708 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS17P08708 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms