Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCCAP05165 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCCAP05165 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCCAP05165 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCCAP05165 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCCAP05165 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCCAP05165 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCCAP05165 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCCAP05165 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCCAP05165 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCCAP05165 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCCAP05165 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCCAP05165 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCCAP05165 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCCAP05165 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCCAP05165 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCCAP05165 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCCAP05165 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCCAP05165 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCCAP05165 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCCAP05165 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PCCAP05165 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCCAP05165 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCCAP05165 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCCAP05165 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCCAP05165 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCCAP05165 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCCAP05165 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCCAP05165 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCCAP05165 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCCAP05165 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCCAP05165 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCCAP05165 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCCAP05165 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCCAP05165 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCCAP05165 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCCAP05165 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCCAP05165 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCCAP05165 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCCAP05165 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCCAP05165 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCCAP05165 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCCAP05165 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCCAP05165 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCCAP05165 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCCAP05165 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCCAP05165 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCCAP05165 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCCAP05165 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCCAP05165 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCCAP05165 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms