Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR3C1P04150 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR3C1P04150 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR3C1P04150 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR3C1P04150 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NR3C1P04150 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR3C1P04150 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms