Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOC2P02655 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOC2P02655 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC2P02655 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC2P02655 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC2P02655 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC2P02655 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
APOC2P02655 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC2P02655 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC2P02655 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC2P02655 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC2P02655 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 527.4 ms