Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFP01375 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFP01375 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFP01375 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFP01375 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFP01375 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFP01375 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFP01375 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFP01375 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFP01375 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFP01375 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFP01375 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFP01375 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFP01375 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFP01375 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFP01375 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFP01375 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFP01375 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFP01375 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFP01375 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFP01375 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFP01375 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFP01375 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFP01375 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms