Protein–RNA interactions for Protein: O95936

EOMES, Eomesodermin homolog, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EOMESO95936 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EOMESO95936 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EOMESO95936 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EOMESO95936 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EOMESO95936 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EOMESO95936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EOMESO95936 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EOMESO95936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EOMESO95936 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EOMESO95936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EOMESO95936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EOMESO95936 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EOMESO95936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EOMESO95936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EOMESO95936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EOMESO95936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EOMESO95936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EOMESO95936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EOMESO95936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EOMESO95936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EOMESO95936 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EOMESO95936 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EOMESO95936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EOMESO95936 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms