Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBX18O95935 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX18O95935 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX18O95935 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX18O95935 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX18O95935 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX18O95935 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX18O95935 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX18O95935 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX18O95935 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX18O95935 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBX18O95935 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBX18O95935 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX18O95935 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX18O95935 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms