Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTLL1O95922 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms