Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D2O95562 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SFT2D2O95562 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms