Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 LINC00630-203ENST00000431616 561 ntTSL 510.16□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP54-205ENST00000424265 5201 ntTSL 29.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 CLIP1-212ENST00000540304 2554 ntTSL 59.96□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ANGEL1-203ENST00000555079 553 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.822e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DPF3-215ENST00000610283 4520 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 HEY1-206ENST00000521111 612 ntTSL 39.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZFYVE16-205ENST00000509562 684 ntTSL 39.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NUP50-214ENST00000469163 3507 ntTSL 29.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 FAXDC2-208ENST00000519501 815 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DNAH1-208ENST00000497875 3833 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 HAUS4-208ENST00000553859 602 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DPF3-216ENST00000614862 4221 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC7A7-215ENST00000555702 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MCM10-206ENST00000484800 3157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 DPF3-202ENST00000381216 3229 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.013e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 SLC35B1-203ENST00000502268 481 ntTSL 38.58□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 USP54-210ENST00000466048 4674 ntTSL 57.97□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 CSNK1G1-217ENST00000635514 790 ntTSL 57.84□□□□□ -1.155e-8■■■■■ 206.8
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SF3B1O75533 TBC1D31-212ENST00000521980 2552 ntTSL 27.68□□□□□ -1.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ROBO2-206ENST00000473767 5393 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LARP1-209ENST00000519194 529 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.16□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 47.15□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46.96□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-206ENST00000628246 443 ntTSL 56.94□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 INTS9-210ENST00000520983 1154 ntTSL 26.88□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-205ENST00000423596 246 ntTSL 56.81□□□□□ -1.323e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 26.78□□□□□ -1.323e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TBC1D31-213ENST00000522276 879 ntTSL 36.75□□□□□ -1.333e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.333e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-208ENST00000452550 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.64□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC005537.1-210ENST00000631088 437 ntTSL 56.59□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 206.8
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