Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9AO75110 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9AO75110 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms