Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUTAO60888 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUTAO60888 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUTAO60888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUTAO60888 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUTAO60888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUTAO60888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUTAO60888 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUTAO60888 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUTAO60888 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUTAO60888 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUTAO60888 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUTAO60888 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUTAO60888 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUTAO60888 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUTAO60888 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms