Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMM17BO60830 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TIMM17BO60830 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMM17BO60830 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms