Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNND1O60716 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNND1O60716 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNND1O60716 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms