Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGTAO43765 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGTAO43765 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGTAO43765 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGTAO43765 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGTAO43765 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGTAO43765 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGTAO43765 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGTAO43765 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGTAO43765 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms