Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYNGR2O43760 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGR2O43760 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms