Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP2AO43633 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP2AO43633 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP2AO43633 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms