Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSI1O43347 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSI1O43347 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSI1O43347 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI1O43347 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI1O43347 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI1O43347 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSI1O43347 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSI1O43347 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSI1O43347 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSI1O43347 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSI1O43347 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSI1O43347 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSI1O43347 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSI1O43347 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSI1O43347 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSI1O43347 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSI1O43347 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSI1O43347 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSI1O43347 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms