Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNN4O15554 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNN4O15554 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNN4O15554 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms