Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SOCS1O15524 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS1O15524 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms