Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPEO14579 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPEO14579 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPEO14579 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPEO14579 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPEO14579 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPEO14579 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPEO14579 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPEO14579 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPEO14579 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPEO14579 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms