Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE40O14503 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHLHE40O14503 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms