Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX7O00628 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX7O00628 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX7O00628 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX7O00628 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX7O00628 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX7O00628 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX7O00628 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX7O00628 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX7O00628 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms