Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFRA2O00451 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFRA2O00451 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms