Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC4-APOC2K7ER74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms