Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H7C0C1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H7C0C1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H7C0C1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H7C0C1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H7C0C1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H7C0C1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H7C0C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H7C0C1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H7C0C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H7C0C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H7C0C1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms