Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms