Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM238C9JI98 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM238C9JI98 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms