Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PATL2C9JE40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PATL2C9JE40 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PATL2C9JE40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PATL2C9JE40 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PATL2C9JE40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PATL2C9JE40 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PATL2C9JE40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PATL2C9JE40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PATL2C9JE40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PATL2C9JE40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms