Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERVV-1B6SEH8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-1B6SEH8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms