Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VGLL3A8MV65 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms