Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL1BA8MQ27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEURL1BA8MQ27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEURL1BA8MQ27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms