Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC169A6NNP5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC169A6NNP5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms