Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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