Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSDA5PKW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms