Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCHNA4D1U4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms