Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPED1A4D0V7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms