Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA8A3KMH1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA8A3KMH1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA8A3KMH1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms