Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCRBV7S3A2A0A539 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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TCRBV7S3A2A0A539 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCRBV7S3A2A0A539 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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