Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J248

TRAV1-1, T-cell receptor alpha variable 1-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-1A0A0B4J248 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV1-1A0A0B4J248 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAV1-1A0A0B4J248 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms