Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms