Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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