Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms