Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms