Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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