Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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COPS7AQ9UBW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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COPS7AQ9UBW8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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COPS7AQ9UBW8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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