Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPASTQ9UBP0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms