Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXXC1Q9P0U4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms