Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMBRD1Q9NUN5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.4 ms